A infecção pelo vírus da hepatite B (HBV) é um grave problema de saúde pública. A progressão da infecção pelo HBV apresenta uma importante relação com a resposta imunológica do hospedeiro. O complexo do antígeno leucocitário humano (HLA) está relacionado à resposta imunológica para a eliminação e controle do HBV. Especificamente, o polimorfismo Indel-14pb (rs371194629) no gene HLA-G têm sido associado com a hepatite B por afetar este processo. Este estudo objetivou avaliar se o polimorfismo Indel-14pb apresenta associação com a infecção crônica pelo HBV em uma amostra de pacientes cronicamente infectados do Sul do Brasil. O delineamento foi caso-controle e inclui 260 casos de hepatite B crônica e 260 controles oriundos de serviços de saúde da cidade de Caxias do Sul (RS), de 2014 a 2016. Amostras de sangue foram coletadas destes indivíduos e o DNA genômico foi extraído. A genotipagem do polimorfismo Indel-14pb foi realizadas por PCR (reação em cadeia da polimerase) seguido de eletroforese em gel de poliacrilamida. Os dados foram avaliados pelo teste do qui-quadrado e razão de chances (RC) com intervalo de confiança (IC95%). Até o momento 216 casos e 214 controles foram genotipados. O genótipo Ins/Ins foi mais frequente no grupo de casos em comparação com os controles (22,0% vs. 11,6%; RC= 2,01; IC95%: 1,14–3,85), assim como a presença do alelo Ins (48,6% vs. 42,6%; RC= 1,30; IC95%: 1,01–1,69). As frequências genotípicas estavam de acordo com o equilíbrio de Hardy-Weinberg (p >0,050). Em conclusão, o polimorfismo Indel-14pb no gene HLA-G foi associado com hepatite B crônica em uma amostra caso-controle de Caxias do Sul.